mardi 14 octobre 2014

1/. Analyse de l’ADN par CGR.
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Il est aisé aujourd’hui de récupérer des séquences d’ADN sur Internet.
L’analyse par CGR permet de transformer une séquence d’ADN en une image.

Voici une image ainsi réalisée :


Cette image est particulière car elle est spécifique de l’espèce dont on analyse l’ADN.
Ainsi on va pouvoir différencier l’ADN d’un homme à celui d’un autre mammifère.

La CGR (Chaos Game Représentation) est un système d’analyse qui permet de représenter en deux dimensions, c’est à dire sur un plan comme une image, une séquence d’ADN.

Le principe de l’analyse d’ADN par CGR est d’utiliser les 4 bases de l’ADN comme autant de points attracteurs qui permettent de créer un point sur un graphique en se rapprochant pour chaque base d’une séquence d’ADN des 4 coins du carré où se trouve les 4 bases ADN. (les 4 bases de l’ADN sont A,T,G ou C) *

… et ou on peut ou récupérer l’ADN ? : ->  http://www.ensembl.org/Homo_sapiens/Info/Index
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A : Adénine
T : Thymine
G : Guanine
C : Cytosine

Ci-dessous le programme que vous pouvez télécharger et utiliser pour faire de belles images.

http://bioimage.fr/stockage_blog/CGR_SITE_WEB.xlsm